Des communautés microbiennes diversifiées jouent un rôle crucial dans le maintien du bon fonctionnement des écosystèmes fluviaux et sont considérées comme des indicateurs importants de la qualité de l'eau des rivières. Si les connaissances à ce sujet sont encore limitées, le développement des techniques avancées de séquençage de l'ADN peut apporter un éclairage précieux.
Dans cette capsule, My Dung JUSSELME du Laboratoire eau environnement et systèmes urbains (LEESU) présente une étude réalisée dans le cadre du programme MeSeine Innovation.
L'objectif était d'étudier la diversité microbienne en Seine francilienne et dans ses affluents, la Marne et l'Oise en utilisant la technologie de séquençage à haut débit pour explorer sa variabilité dans le temps et entre l'amont et l'aval de l'agglomération parisienne.