Suivi des communautés microbiennes en Seine comme reflets des pressions anthropiques

M.D. JUSSELME, S. BAGAGNAN, A. MARCONI, S. GUÉRIN-RECHDAOUI, V. ROCHER, R. MOILLERON Tecnhiques Sciences Méthodes - 2025 - Numéro 1/2 2025

La Seine, le plus important fleuve de France et l’un des plus fortement impactés par les activités humaines, abrite une grande biodiversité, notamment une abondance et une diversifié des micro-organismes. Étroitement liées aux paramètres physico-chimiques, les communautés microbiennes jouent un rôle crucial dans son fonctionnement et sont sensibles aux variations environnementales telles que celles du pH, de la température, des concentrations en nutriments et à la présence de contaminants. La diversité des communautés microbiennes est un bon indicateur de l’état écologique et du bon fonctionnement des écosystèmes. Dans le cadre de cette étude, la qualité des eaux de la Seine, de la Marne et de l’Oise a été étudiée en s’appuyant sur la caractérisation de leur diversité microbienne. Les résultats montrent que la Seine présente un profil caractéristique d’une diversité microbienne similaire à celle observée dans d’autres rivières urbaines, contribuant à une large gamme de fonctions écologiques. Les principaux phyla sont les Proteobacteria, les Actinobacteria, Bacteroidota et Firmicutes. Des variations temporelles de l’abondance relative des différents groupes microbiens ont été observées, soulignant l’influence des conditions environnementales, en particulier la température et le débit. De plus, les résultats d’expérimentations réalisées en laboratoire en conditions contrôlées montrent que cette diversité présente une capacité de résilience face à l’apport de effluents de station d’épuration (STEP) traités à l’acide performique. Les résultats de cette étude ont permis d’établir un état de référence de la diversité microbienne en Seine, qui permettra dans le futur de suivre son évolution, notamment avec la mise en place généralisée de la désinfection des effluents de STEP.

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