La Seine abrite une très grande diversité microbienne jouant un rôle crucial dans la qualité de l'eau et les fonctionnements d’écosystèmes fluviaux.
Cette diversité est potentiellement influencée par plusieurs facteurs, notamment les rejets urbains contenant des polluants, et les variations saisonnières. Elle est donc utilisée comme un indicateur vital de la santé de la rivière.
Dans cette capsule, My Dung JUSSELME du Laboratoire eau environnement et systèmes urbains (LEESU) présente une étude réalisée dans le cadre du programme MeSeine Innovation. L'objectif était d'étudier la diversité microbienne de la Seine francilienne et de ses affluents en prenant en compte la dynamique saisonnière sur les 4 saisons de l’année.
Pour cela, sept sites ont été suivis, à toutes saisons, en Seine Francilienne et sur ses affluents, la Marne et l'Oise . Les eaux de surface prélevées on analysées par la technique de séquençage à haut débit pour étudier l'ADN des microorganismes présents.